Večina običajnih orodij in programov s sistema Unix je bila prirejena za Linux, vključno s skoraj vso robo GNU in veliko odjemniki X iz različnih virov. Pravzaprav beseda ,prirejen` niti ni na mestu, saj se zaradi precej natančnega upoštevanja priporočil POSIX veliko programov prevede popolnoma brez sprememb, ali le z malenkostnimi spremembami. Žal še ni toliko aplikacij za končnega uporabnika, kot bi si želeli, vendar pa se situacija popravlja. Stopite v stik s proizvajalcem svoje najljubše komercialne aplikacije za Unix in ga povprašajte, če jo je že priredil za Linux.
Sledi nepopoln spisek programja, ki preverjeno dela z Linuxom:
ls, tr, sed, awk in tako dalje (česarkoli se
spomnite -- Linux ga verjetno ima).
gcc, gdb, make, bison, flex, perl,
rcs, cvs, prof.
C, C++, Objective C, Java, Modula-3, Modula-2, Oberon, Ada95, Pascal, Fortran, ML, scheme, Tcl/tk, Perl, Python, Common Lisp, in mnogi drugi.
Namizja GNOME in KDE, X11R5 (XFree86 2.x), X11R6 (XFree86 3.x), MGR.
GNU Emacs, XEmacs, MicroEmacs, jove, ez, epoch,
elvis (GNU vi), vim, vile, joe, pico,
jed, in drugi.
bash (združljiva s POSIX sh), zsh (vključuje način,
združljiv s ksh), pdksh, tcsh, csh, rc,
es, ash (večinoma s sh združljiva ukazna lupina, ki jo
BSD uporablja kot /bin/sh), in mnoge druge.
PPP, UUCP, SLIP, CSLIP, celoten nabor programov TCP/IP,
kermit, szrz, minicom, pcomm, xcomm,
term (poganja več ukaznih lupin, preusmerja omrežne
aktivnosti in dovoljuje oddaljeni X, vse prek ene modemske
linije), Seyon (priljubljen komunikacijski program za X
Windows), in več paketov za fax in glasovno pošto (prek modemov
ZyXEL in drugih). Seveda sta podprti tudi oddaljena serijska in
omrežna prijava.
C-news, innd, trn, nn, tin, smail,
elm, mh, exmh,pine, mutt itd.
TeX, LaTeX, groff, doc, ez, LyX, Lout,
Linuxdoc-SGML, in drugi.
Nethack, več MUD-ov in igric za X, in mnoge druge. Ena od teh igric gleda za razpoložljivimi igricami na tsx-11 in sunsite.
Vsi navedeni programi (in zgoraj navedeni ne predstavljajo niti stotine vseh dosegljivih) so prosto dostopni. Vse več je tudi komercialnega programja; povprašajte proizvajalca vašega priljubljenega komercialnega programa, če podpirajo Linux.